ОСОБЕННОСТИ ПОЛИМОРФИЗМА D-ПЕТЛИ мтДНК МЕСТНЫХ ПОРОД ЛОШАДЕЙ РОССИИ


Авторы: Блохина Н. В., канд. с.-х. наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики; nbloh16@yandex.ru; ORCID ID https;//orcid.org/0000-0001-7406-6385; Храброва Л. А. док. с.-х. наук, профессор, главный научный сотрудник; l.khrabrova@yandex.ru; ORCID ID https;//orcid.org/0000-0003-2590-8472; ФГБНУ «ВНИИ коневодства»; Россия, 391105, Рязанская область, Рыбновский район, п. Дивово.


МтДНК используется для изучения эволюционных процессов и оценки филогенетических связей между видами и породами. Данные о строении митохондриального генома все шире применяются для характеристики внутрипородной изменчивости и матрилинейной структуры пород лошадей [1]. Целью наших исследований являлось изучение вариабельности мтДНК у лошадей 4 северных лесных пород и анализ их филогенетических связей. Материалом для исследований послужили пробы волос 53 лошадей местных пород, включая 22 вятских, 16 приобских, 5 мезенских и 10 якутских. Анализ последовательности D-петли мтДНК с 15471- 1600 п.н. проводили c учетом референсного генома X79547 [2] и базы данных GenBank о гаплотипах 20 якутских (DQ32280-DQ328057), 18 мезенских (DQ327968-DQ327985) и 18 вятских лошадей (DQ328020- DQ328037). Для филогенетического анализа связи пород использовали модель максимального правдоподобия (MCL) в сочетании с бутстреп анализом (60%). Полученные данные обрабатывали с использованием программы MEGA7. У лошадей местных северных пород было выявлено 106 гаплотипов мтДНК, относящихся к 16 из 18 известных гаплогрупп и дополнительно 3 новых гаплогруппы X, Y и Z. При этом во всех породах лошадей была отмечена высокая индивидуальная вариабельность гаплотипов мтДНК. Варианты гаплогрупп А и L встречались у лошадей всех исследуемых пород. Местные породы лошадей северного ареала заметно различались между собой по своей матрилинейной структуре. Установлены существенные различия в матрилинейной структуре северных местных пород лошадей, подтверждающие уникальность их генофондов.
Исследования проводились при поддержке Российского научного фонда (проект №. 19-7620058)


Литература:
1. Cothran E.G., Juras R., Macijauskiene V. Mitochondrial DNA D-loop sequence variations among 5 maternal lines of the Zemaitukai horse breed. Genet. Mol. Biol. (2005); 28(4): 677-681.
2. Xu, X., Arnason U. The complete mitochondrial DNA sequence of the horse, Equus caballus: extensive heteroplasmy of control region. Gene. (1994); 148(2):357-362.