Лаборатория молекулярной организации генома
Лаборатория молекулярной организации генома была создана в 1993 году и первым руководителем лаборатории стал доктор биологических наук Смирнов Александр Федорович. В разные годы лабораторией заведовали кандидат биологических наук Н. С. Никитин и доктор биологических наук А.А. Сазанов. Задачей лаборатории было комплексное изучение структурно-функциональной организации генома сельскохозяйственных животных. Была построена количественная версия цитогенетической карты крупного рогатого скота Bos taurus высокого разрешения с помощью RBA метода дифференциального окрашивания и описана цитохимическая неоднородность его хромосом с помощью гибридизации in situ с сатДНК 1,715 г/cм3 , 1,723 г/cм3 (Чиряева О.Г.). С помощью гибридизации in situ были картированы на хромосомах крупного рогатого скота клонированные последовательности сателлитных ДНК и гены HPRT и ZFY (Логинова Ю.А.). В результате скринирования геномного банка Bos taurus выявлны клоны, содержащие предполагаемые тестис определяющие гены ZFY и SRY (Босак Н.П.). Также, изучена изменчивость сателлитных ДНК 11 и 1V у представителей семейства Bovidae (крупный рогатый скот, бизон, бантенг, як и гибридов як х крупный рогатый скот (Павлова В.А.) и специфика хромосомной организации у этих видов (Треус В.В., Прошина О.В.). Произведен анализ молекулярно — цитогенетических маркеров (рДНК, теломерная ДНК) у домашней лошади Equus caballus и лошади пржевальского Equus.przewalski (Дюрешева С.Е.). Осуществлена локализация некоторых нуклеотидных послевательностей (В- подобные глобиновые гены., ген трансферинового рецентора . гомологичные v-fos, ГЦ богатого минисателита и др.) на хромосомах курицы Gallus gallus domesticus (Сазанов А.А.). Описан полиморфизм TG обогащенной минисателлитной ДНК домашней курицы с помощью фингерпринтинга (Чуркина И.В.). Получены трансгенные кролики с помощью переноса мини гена релизинг-фактора гормона роста (совместно с сотрудниками института генетики животных Польской академии наук, Ястремжиец-Варшава). Исследовано моделирование гетерохроматиновых районов хромосом у трансгенных мышей при переносе фрагмента сатДНК 1V Bos taurus L. (Попов А.В.).
Также, была выявлена псевдо аутосомная область в Z хромосоме кур (Сазанов А.А., Романов М.). В 2006 году была создана карта хромосомной локализации QTL, определяющих молочную продуктивность коров, которая наиболее полно содержала все найденные к тому времени QTL (Смарагдов М.Г.). В 2009 году был опубликован обзор, посвященный появлению нового направления в селекции молочного скота, получившего название геномная селекция, целью которого было обратить внимание российских селекционеров на перспективность использования молекулярных маркеров (SNP) в селекции крупного рогатого скота (Смарагдов М.Г.). В 2010 году ведущий сотрудник лаборатории Смарагдов М.Г., единственный участник из России, представлял ВНИИГРЖ на мировом конгрессе по прикладной генетике. В сотрудничестве с польскими исследователями была обнаружена РНК с разным уровнем экспрессии у кур, несущих яйца с толстой и тонкой скорлупой (Сазанов А.А.). Рядом с участком ДНК кодирующим эту РНК были идентифицированы шесть SNP, три из которых ассоциировали с толщиной скорлупы яйца (Сазанов А.А., Баркова О.Ю.).
В 2011 году руководителем лаборатории стал канд. биол. наук Смарагдов Михаил Григорьевич. В 2011-2013 году получены данные об эффекте замещения аллелей в генах DGAT1 и GHR (Смарагдов М.Г.). Также, была найдена ассоциация маркерной SNP в гене KCNQ3 c содержанием жира в молоке коров и построена карта неравновесия SNPs в этом гене (Смарагдов М.Г., Мукий Ю.В.). Были продолжены исследования направленные на выявление генов – кандидатов, влияющих на толщину скорлупы яйца (Баркова О.Ю., Смарагдов М.Г.) и содержания жира в молоке коров.
Баркова О. Ю.
Кудинов А. А.