…
Генетика и разведение животных, 2018, № 1, С. 3-10
УДК 636.2.034
Работа выполнена в рамках выполнения задания Федерального агентства научных организаций (ФАНО) № ГЗ АААА-А18-118021590138-1 в 2018 г.
ХАРАКТЕРИСТИКА АЛЛЕЛОФОНДА ЛОКАЛЬНЫХ ПОРОД КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА РОССИИ ПО МИКРОСАТЕЛЛИТНЫМ МАРКЕРАМ
В. В. ВОЛКОВА¹, Т. Е. ДЕНИСКОВА¹, О. В. КОСТЮНИНА¹, Х. А. АМЕРХАНОВ², Т. И. ДОБРЫНИНА³, Н. А. ЗИНОВЬЕВА¹
Аннотация. Локальные породы крупного рогатого скота являются источником ценных генов и важной частью культурного наследия регионов их выведения, поэтому необходимо принимать меры по устойчивому управлению этими генетическими ресурсами. В связи с этим, цель нашей работы — это характеристика современного аллелофонда, оценка уровня генетического разнообразия и изучение генетических взаимосвязей популяций девяти отечественных аборигенных и локально-созданных пород крупного рогатого скота (n = 835), в том числе: бестужевская (BEST), калмыцкая (KALM), костромская (KOST), красная горбатовская (RGBT), суксунская (SUKS), холмогорская (HOLM), ярославская (YARS), якутская (YAKT) и тагильская (TAGL). Полиморфизм 10 микросателлитных локусов изучался на генетическом анализаторе ABI3130xl. Эффективное число аллелей варьировало от 4,56 в TAGL до 2,78 аллелей у YAKT, в то время как число информативных аллелей было ранжировано от 3,50 в YAKT до 5,30 аллелей в KALM. У 8 из 9 пород уровень наблюдаемой гетерозиготности превышал 0,66. Попарные значения Fst между локальными породами скота характеризовали незначительную (от 0,023 до 0,045) или умеренную (от 0,050 до 0,106) генетическую дифференциацию. YAKT была наиболее обособленной (DN. от 0,315 до 0,518; Fst от 0,70 до 0,106). Пары RGBT и SUKS (Fst = 0,026), KALM и BEST (Fst = 0,023), а также TAGL и BEST (Fst = 0,022) занимали соседствующие позиции на PCoA плоте. Анализ AMOVA показал, что 89% генетической изменчивости приходилось на внутригрупповую изменчивость, в то время как 11% изменчивости составляли межгрупповые различия. Таким образом, проведенные исследования дают наиболее полные сведения о состоянии аллелофонда, генетическом разнообразии и дифференциации девяти локальных отечественных пород крупного рогатого скота.
CHARACTERISTIC OF ALLELE POOL OF LOCAL CATTLE BREEDS OF RUSSIA BASED ON MICROSATELLITE MARKERS
VOLKOVA V. V.¹, DENISKOVA T. E.¹, KOSTYUNINA O. V.¹, AMERKHANOV H. A.², DOBRYNINA T. I.³, ZINOVIEVA N. A.¹
Abstract. Local cattle breeds are source of valuable genes and an important part of cultural heritage of the breeding regions, it is therefore important to take measures that promote a sustainable management of these genetic resources. In this regard, aim of our work is characterization of the present allele pool, an assessment of level of genetic diversity and a study of genetic relationships of populations of nine native and locally developed Russian cattle breeds (n=835), including Bestuzhev (BEST), Kalmyk (KALM), Kostromsky (KOST), Red Gorbatov
(RGBT), Suksun (SUKS), Kholmogor (HOLM), Yaroslavl (YARS), Yakut (YAKT) and Tagil (TAGL). Polymorphism of 10 microsatellite loci was studied on genetic analyzer ABI3130xl. Effective number of alleles variedfrom 2.78 in YAKT to 4.56 alleles in TAGL, while number of informative alleles ranged from 3.50 in YAKT to 5.30 alleles in KALM. In 8 of 9 breeds level of observed heterozygosity exceeded 0.66. Pairwise Fst values showed an insignificant (from 0.023 to 0.045) or moderate (from 0.050 to 0.106) genetic differentiation between local
cattle breeds. YAKT was the most separated (DN from 0.315 to 0.518, Fst from 0.70 to 0.106). The pairs RGBT and SUKS (Fst=0.026), KALM and BEST (Fst=0.023), as well as TAGL and BEST (Fst=0.022) occupied the neighboring positions on the PCoA plot. The AMOVA showed that 89% of the genetic variability was due to variability within the groups, while 11% of variability was intergroup differences. Thus, our research represents the most complete information on the state of the allele pool, genetic diversity and differentiation of nine local Russian cattle breeds.
¹ Федеральный научный центр животноводства — ВИЖ имени академика Л. К. Эрнста, 142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, д. 60;
² Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Российский государственный аграрный университет — МСХА имени К.А. Тимирязева», 127550, г. Москва, Тимирязевская ул., 49;
³ СПК имени Шорохова, 617855, Пермский край, Октябрьский район, село Тюинск, Молодежная ул., дом 5.