БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ФРАГМЕНТА ГЕНА ЦИТОХРОМОКСИДАЗА МТДНК ПАЛТУСОВ (PLEURONECTIDAE)

С. П. ПУСТОВОЙТ ¹, Р. Р. ЮСУПОВ ²

Аннотация. Проведен сравнительный биоинформационный анализ нуклеотидного состава участка гена цитохромоксидаза субъединицы 1 мтДНК североохотоморских палтусов с представителями других родов палтусов. Статистический анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена цитохромоксидаза 1 (Co-1) мтДНК тихоокеанского белокорого палтуса Hippoglossus stenolepis позволил оценить гаплотипическое разнообразие – 0,852 ± 0,0059, нуклеотидное – 0,00430 ± 0,009465. Около 1% от всей величины нуклеотидного разнообразия у особей белокорого палтуса определяется генетическим различиями между североохотоморскими и североамериканскими популяциями. Анализ нуклеотидных последовательностей этого же гена у тихоокеанского черного палтуса Reinhardtius hippoglossoides matsuurae определил гаплотипическое разнообразие – 0,806 ± 0,0399, нуклеотидное разнообразие – 0,00185 ± 0,000149. Около 6% общей величины нуклеотидного разнообразия определяется межпопуляционными различиями между особями, отловленными в восточной и западной части ареала. Минимальная величина гаплотипического разнообразия определена у северной палтусовидной камбалы Hippoglossoides robustus, при этом у второго вида данного рода Hippoglossoides platessoides гаплотипическое разнообразие сходно с представителями двух других родов Cleisthenes и Hippoglossus. Максимальное значение гаплотипического разнообразия найдено у остроголовой камбалы – Cleisthenes herzensteini, представители родов Atheresthes и Reinchardtius имеют промежуточные значения. Вид Atheresthes stomias резко отделен от видов прочих родов, что связано с высокой степенью генетических отличий представителей данного рода от таковых из других родов.

BIOINFORMATION ANALYSIS OF NUCLEOTIDE SEQUENCES OF THE FRAGMENT OF THE GENE CYTOCHROME OXIDASE OF HALIBUT (PLEURONECTIDAE)

S. PUSTOVOIT ¹, R. YUSUPOV ²

Abstract. Comparative bioinformation analysis of nucleotide composition of subunit 1 cytochrome oxydase gene (Co-1) mtDNA subunit of north-okhotomore population with representatives of other halibut genera was carried out. Statistical analysis of nucleotide sequences of a fragment of the gene cytochrome oxidase mtDNA of pacific halibut Hippoglossus stenolepis: haplotype diversity 0.852 ± 0.0059, nucleotide 0.00430 ± 0.009465. About 1% of the total value of nucleotide diversity in individuals from eastern and western regions is determined. Analysis of nucleotide sequences of the same gene in pacific greenland halibut Reinhardtius hippoglossoides matsuurae: haplotype diversity was 0.806 ± 0.0399, nucleotide diversity — 0.00185 ± 0.000149. About 6% of the relative value of nucleotide diversity is determined by interpopulation differences. The minimum value of haplotype diversity was determined in the northern halibut flounder Hippoglossus robustus, while in the second species of this genus Hipploglossus platessoides, the haplotype diversity is similar to the representatives of two genera Cleisthenes and Hippoglossus. The maximum value of haplotypic diversity was found in the Cleisthenes herzensteini, representatives of the Atherestes and Reinchardtius genera have intermediate values. The species Atherestes stomias is sharply separated from species of other genera, which is associated with a high degree of genetic differences between representatives of this genus and those from other genera.

¹ Северо-Восточный государственный университет; 685000, Россия, Магаданская область, ул. г. Магадан, Портовая, д. 13;

² НИИ биологических проблем Севера ДВО РАН; 685000, Россия, Магаданская область, ул. г. Магадан, Портовая, д. 18.