Генетика и разведение животных, 2019, № 1, С. 3-8


УДК 636.32/.38

При выполнении исследований использовано оборудование Центра коллективного пользования научным оборудованием «Биоресурсы и биоинженерия сельскохозяйственных животных» ФГБНУ ФНЦ ВИЖ им. Л. К. Эрнста.

Работа проведена в рамках выполнения фундаментальных научных исследований Министерства науки и высшего образования РФ по теме 0445-2019-0026, № 6 (АААА-А18-118021590138-1).


ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ЛОКАЛЬНЫХ ПОРОД ОВЕЦ РЕСПУБЛИКИ ТАДЖИКИСТАН НА ОСНОВЕ ПРИМЕНЕНИЯ STR-МАРКЕРОВ

Т. Е. ДЕНИСКОВА¹, Н. А. РАДЖАБОВ¹ ², А. Н. МАХМАДШОЕВ², В. А. БАГИРОВ¹, Н. А. ЗИНОВЬЕВА¹

Аннотация. Природные условия Республики Таджикистан способствовали активному развитию овцеводства. В связи с этим, было выведено большое количество выносливых и высокопродуктивных локальных пород. В настоящей работе представлено генетическое исследование овец гиссарской, таджикской и памирской тонкорунной пород с помощью микросателлитов. Полиморфизм 11 STR-локусов был изучен с использованием генетического анализатора. Статистическая обработка и визуализация данных были проведены в программах GenAIEx 6.503, PAST и Structure 2.3.4. Эффективное число аллелей варьировала от 2,81 у группы тонкорунных овец до 5,16 у группы таджикских овец. У таджикских, тонкорунных и гиссарских овец было обнаружено 5,73; 3,36 и 4,91 информативных аллелей на локус. Наибольший уровень генетического разнообразия был обнаружен у таджикских овец. Во всех группах был зафиксирован дефицит гетерозигот, который составил 8,2%; 10,2% и 18,2% у овец таджикской, гиссарской и памирской тонкорунной пород, соотвественно. На основе матрицы генетических дистанций по М.Нею по методу невзвешенного попарного среднего (UPGMA) было построено филогенетические древо. Гиссарские и таджикские овцы формировали кластер в виду общности происхожения. Значения показателя Fst свидетельствовали об умеренной дифференциации и составили 0,123 между овцами гиссарской и таджикской пород; 0,189 между овцами тонкорунной и таджиской пород и 0,239 между овцами гиссарской и тонкорунной пород. Для установления принадлежности особи к группе был проведен кластерный анализ в программе STRUCTURE. Все индивидуумы были отнесены к своим кластерам. Средние значения критерия членства в своем кластере были высокими во всех группах и составили Q1/3= 0,967±0,014; Q2/3=0,990±0,004 и Q3/3=0,971±0,010 для овец таджикской, тонкорунной и гиссарской пород, соответственно. Таким образом, изучаемые группы овец являются четко обособленными друг от друга и характеризуются высокой внутрипородной консолидированностью. Исследования будут продолжены на большем поголовье.

GENETIC ASSESSMENT OF LOCAL SHEEP BREEDS OF THE REPUBLIC OF TAJIKISTAN BASED ON STR MARKERS

T. DENISKOVA, N. RADJABOV, A. MAKHMADSHOEV , V. BAGIROV, N. ZINOVIEVA

Abstract. The natural conditions of the Republic of Tajikistan had promoted the rise of sheep breeding. In this regard, many hardy and highly productive local breeds were obtained. Here, we presented a genetic study of the Gissar, Tajik and Pamir fine-fleeced sheep based on microsatellites. The polymorphism of 11 STR loci was studied using a genetic analyzer. Statistical processing and data visualization were performed in software GenAIEx 6.503, PAST and Structure 2.3.4. The effective number of alleles varied from 2.81 in the group of fine-fleeced sheep to 5.16 in the group of Tajik sheep. There were found 5,73; 3.36 and 4.91 informative alleles per locus in the Tajik, fine-fleeced and Gissar sheep, respectively. The highest level of genetic diversity was identified in the Tajik sheep. In all groups, there was a deficit of heterozygotes, which was 8.2%; 10.2% and 18.2% in the Tajik, Gissar and Pamir fine-fleeced sheep breeds, respectively. Based on the matrix of Nei`s genetic distances, a phylogenetic tree was constructed using UPGMA method. The Gissar and Tajik sheep formed a cluster according their common origin. The pairwise Fst values showed a moderate differentiation and were 0.123 between the Gissar and Tajik sheep; 0.189 between the Pamir fine-wool and Tajik sheep and 0.239 between the Gissar and Pamir fine-wool sheep. To establish the individual assignment to a group, cluster analysis was performed in STRUCTURE. All sheep were assigned to their own clusters. The average values of the membership criterion in own cluster were high in all groups and were to Q1/3 = 0.967 ± 0.014 ; Q2/3 = 0.990 ± 0.004 and Q3/3 = 0.971 ± 0.010 for the Tajik, Pamir fine-fleeced and Gissar sheep, respectively. Thus, the studied sheep groups are clearly differentiated and are characterized by high withinbreed consolidation. Research will be continued on a larger sample.

1 Федеральный научный центр животноводства — ВИЖ имени академика Л. К. Эрнста, 142132, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, д. 60;

2 Институт животноводства Таджикской Академии сельскохозяйственных наук (ТАСХН), 734067, г. Душанбе, Гипрозем городок, д. 17.